Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ep400Q8CHI8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms