Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upp2Q8CGR7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Upp2Q8CGR7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Upp2Q8CGR7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp2Q8CGR7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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