Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc43a2Q8CGA3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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