Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Setd1bQ8CFT2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms