Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms