Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE50

Snx30, Sorting nexin-30, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx30Q8CE50 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx30Q8CE50 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms