Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc17Q8CE13 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms