Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam228aQ8CDW1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms