Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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