Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms