Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn5Q8CBA2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms