Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntrobQ8CB62 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms