Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dclre1bQ8C7W7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms