Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7I4

Apol9b, Apolipoprotein L 9b, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9bQ8C7I4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apol9bQ8C7I4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms