Protein–RNA interactions for Protein: Q8C570

Rae1, mRNA export factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rae1Q8C570 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rae1Q8C570 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rae1Q8C570 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rae1Q8C570 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rae1Q8C570 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms