Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfrp1Q8C4U3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Sfrp1Q8C4U3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms