Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3W1

Uncharacterized protein C1orf198 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C3W1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C3W1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3W1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3W1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3W1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C3W1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms