Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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