Protein–RNA interactions for Protein: Q8C263

Ska3, Spindle and kinetochore-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska3Q8C263 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ska3Q8C263 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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