Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B1

Camsap2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camsap2Q8C1B1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Camsap2Q8C1B1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Camsap2Q8C1B1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms