Protein–RNA interactions for Protein: Q8C084

Snx22, Sorting nexin 22, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx22Q8C084 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Snx22Q8C084 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx22Q8C084 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx22Q8C084 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx22Q8C084 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx22Q8C084 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx22Q8C084 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx22Q8C084 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx22Q8C084 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx22Q8C084 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx22Q8C084 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx22Q8C084 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx22Q8C084 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx22Q8C084 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx22Q8C084 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx22Q8C084 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms