Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sall4Q8BX22 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms