Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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