Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPC6

Probable isocitrate dehydrogenase [NAD] gamma 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BPC6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8BPC6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8BPC6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8BPC6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8BPC6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8BPC6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8BPC6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8BPC6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8BPC6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8BPC6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms