Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms