Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo38Q8BMI0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms