Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem260Q8BMD6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms