Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Prpf18Q8BM39 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Prpf18Q8BM39 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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Prpf18Q8BM39 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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Prpf18Q8BM39 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Prpf18Q8BM39 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Prpf18Q8BM39 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Prpf18Q8BM39 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Prpf18Q8BM39 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Prpf18Q8BM39 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Prpf18Q8BM39 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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Prpf18Q8BM39 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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