Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLY1

Smoc1, SPARC-related modular calcium-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smoc1Q8BLY1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smoc1Q8BLY1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms