Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJD1

Itih5, Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H5, mousemouse

Predictions only

Length 952 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itih5Q8BJD1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itih5Q8BJD1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms