Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms