Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHH8

Clrn3, Clarin-3, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3Q8BHH8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Clrn3Q8BHH8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Clrn3Q8BHH8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Clrn3Q8BHH8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Clrn3Q8BHH8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Clrn3Q8BHH8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Clrn3Q8BHH8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn3Q8BHH8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Clrn3Q8BHH8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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