Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smndc1Q8BGT7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms