Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Best2Q8BGM5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms