Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms