Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Trim6Q8BGE7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Trim6Q8BGE7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Trim6Q8BGE7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Trim6Q8BGE7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Trim6Q8BGE7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Trim6Q8BGE7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim6Q8BGE7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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