Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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