Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pknox2Q8BG99 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms