Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-M10.6Q85ZW5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M10.6Q85ZW5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M10.6Q85ZW5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M10.6Q85ZW5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M10.6Q85ZW5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M10.6Q85ZW5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M10.6Q85ZW5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M10.6Q85ZW5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M10.6Q85ZW5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M10.6Q85ZW5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M10.6Q85ZW5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M10.6Q85ZW5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M10.6Q85ZW5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M10.6Q85ZW5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M10.6Q85ZW5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M10.6Q85ZW5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M10.6Q85ZW5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M10.6Q85ZW5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M10.6Q85ZW5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M10.6Q85ZW5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M10.6Q85ZW5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M10.6Q85ZW5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M10.6Q85ZW5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M10.6Q85ZW5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M10.6Q85ZW5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M10.6Q85ZW5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M10.6Q85ZW5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M10.6Q85ZW5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M10.6Q85ZW5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M10.6Q85ZW5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M10.6Q85ZW5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M10.6Q85ZW5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M10.6Q85ZW5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M10.6Q85ZW5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M10.6Q85ZW5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M10.6Q85ZW5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M10.6Q85ZW5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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