Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms