Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc172Q810N9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms