Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem39bQ810L4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tmem39bQ810L4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tmem39bQ810L4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem39bQ810L4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem39bQ810L4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem39bQ810L4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem39bQ810L4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem39bQ810L4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem39bQ810L4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem39bQ810L4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem39bQ810L4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem39bQ810L4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem39bQ810L4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem39bQ810L4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem39bQ810L4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem39bQ810L4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem39bQ810L4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem39bQ810L4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem39bQ810L4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms