Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Cldn34b3Q80ZS5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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