Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms