Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y20

Alkbh8, Alkylated DNA repair protein alkB homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh8Q80Y20 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Alkbh8Q80Y20 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh8Q80Y20 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms