Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc28Q80XJ3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms