Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nrde2Q80XC6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrde2Q80XC6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms