Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Pcsk9Q80W65 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Pcsk9Q80W65 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Pcsk9Q80W65 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Pcsk9Q80W65 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Pcsk9Q80W65 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Pcsk9Q80W65 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Pcsk9Q80W65 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Pcsk9Q80W65 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Pcsk9Q80W65 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Pcsk9Q80W65 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Pcsk9Q80W65 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Pcsk9Q80W65 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Pcsk9Q80W65 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms