Protein–RNA interactions for Protein: Q80W47

Wipi2, WD repeat domain phosphoinositide-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wipi2Q80W47 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Wipi2Q80W47 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms