Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms